בניגוד לכל התרופות המטפלות בסימפטומים בלבד, הטיפול החיסוני התת לשוני מטפל בגורמים לאלרגיה. טיפות נגד אלרגיה נלקחות במינונים גדלים והולכים עד שהמטופל מפתח עמידות לחומר שגורם לאלרגיה.